Selvom beskæring af æbletræet kan være nødvendigt, er udtynding en langt mere skånsom og effektiv tilgang. Udtynding indebærer, at man reducerer antallet af æbler på træet for at sikre en bedre balance mellem frugt og blade. For mange æbler i forhold til bladene betyder, at frugterne ikke modtager tilstrækkelig næring og sukker. En tommelfingerregel er, at der bør være cirka ti blade per æble for at opnå den optimale smag. Der bør også være omkring ti centimeters afstand mellem æblerne.
Både saks og hænder kan anvendes til at fjerne de overskydende æbler, men saksen giver et renere og mere præcist snit. Udtynding af æbletræet er en omhyggelig proces, men den kan have en betydelig indvirkning på kvaliteten af din æblehøst, ofte i højere grad end en traditionel beskæring.